Το Αρεταίειο Νοσοκομείο διοικείται αυτοτελώς από 7μελές Διοικητικό Συμβούλιο το οποίο ονομάζεται «Εφορεία» και η οποία ορίζεται από την Ιατρική Σχολή και το Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Η σύνθεση της Εφορείας του Αρεταιείου Νοσοκομείου από 01-09-2023 έως 31-08-2025 είναι:

ΠΡΟΕΔΡΟΣ:
Κωνσταντίνος Τσιούφης του Παναγιώτη, μέλος ΔΕΠ - καθηγητής πρώτης βαθμίδας της Ιατρικής Σχολής - Αντιπρόεδρος του Τμήματος Ιατρικής Σχολής Επιστημών Υγείας.

ΑΝΤΙΠΡΟΕΔΡΟΣ:
Νικολέττα Ιακωβίδου του Μάκη, μέλος ΔΕΠ - καθηγήτρια πρώτης βαθμίδας της Ιατρικής Σχολής - Διευθύντρια της Νεογνολογικής Κλινικής του Αρεταιείου Νοσοκομείου.

ΤΑΚΤΙΚΑ ΜΕΛΗ:

1. Μανούσος Κωνσταντουλάκης του Ματθαίου, μέλος ΔΕΠ - καθηγητής πρώτης βαθμίδας της Ιατρικής Σχολής - Διευθυντής Β΄ Χειρουργικής Κλινικής του Αρεταιείου Νοσοκομείου.  
2. Νικολέττα Ιακωβίδου του Μάκη,μέλος ΔΕΠ - καθηγήτρια πρώτης βαθμίδας της Ιατρικής Σχολής - Διευθύντρια της Νεογνολογικής Κλινικής του Αρεταιείου Νοσοκομείου.
3. Λία - Ευαγγελία Μουλοπούλου του Σπυρίδωνος, μέλος ΔΕΠ - καθηγήτρια πρώτης βαθμίδας της Ιατρικής Σχολής - Διευθύντρια του Α΄ Ακτινολογικού Εργαστηρίου του Αρεταιείου Νοσοκομείου.
4. Νικόλαος Βλάχος του Φωτίου, μέλος ΔΕΠ - καθηγητής πρώτης βαθμίδας της Ιατρικής Σχολής - Διευθυντής Β΄ Μαιευτικής - Γυναικολογικής Κλινικής του Αρεταιείου Νοσοκομείου.
5. Μαρία Σταματοπούλου του Παναγιώτη, υπάλληλος του κλάδου ΠΕ Νοσηλευτικής με βαθμό Α΄, εκπρόσωπος Νοσηλευτικού Προσωπικού- αιρετό μέλος - με βαθμό Α΄.
6. Χρήστος Βασιλόπουλος του Αλεξάνδρου , υπάλληλος του κλάδου ΤΕ Τεχνολογίας Τροφίμων με βαθμό Α΄,εκπρόσωπος λοιπών εργαζομένων - αιρετό μέλος - με βαθμό Α'.

ΑΝΑΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΑ ΜΕΛΗ:

1. Αχιλλέας Χατζηϊωάννου του Νικολάου, μέλος ΔΕΠ - καθηγητής πρώτης βαθμίδας της Ιατρικής Σχολής, αναπληρωματικό μέλος του Μανούσου Κωνσταντουλάκη.
2. Ιωάννης Κόντης του Χρήστου, μέλος ΔΕΠ - καθηγητής πρώτης βαθμίδας της Ιατρικής Σχολής, αναπληρωματικό μέλος της Νικολέττας Ιακωβίδου. 
3. Νικόλαος Δάφνιος του Ανδρέα, μέλος ΔΕΠ - καθηγητής πρώτης βαθμίδας της Ιατρικής Σχολής, αναπληρωματικό μέλος της Λίας - Ευαγγελίας Μουλοπούλου.
4. Θεοδόσιος Θεοδοσόπουλος του Κωνσταντίνου Ευαγγέλου, μέλος ΔΕΠ - καθηγητής πρώτης βαθμίδας της Ιατρικής Σχολής, αναπληρωματικό μέλος του Νικόλαου Βλάχου.
5. Ελισσάβετ Μανιατέλλη του Σωτηρίου, υπάλληλος του κλάδου ΤΕ Μαιευτικής με βαθμό Α΄, αναπληρωματικό μέλος της Μαρίας Σταματοπούλου.
6. Ανδρέας Χρυσικός του Κωνσταντίνου, υπάλληλος του κλάδου ΔΕ Πληροφορικής με βαθμό Α΄, αναπληρωματικό μέλος του Χρήστου Βασιλόπουλου.