Οι διοικητικές υπηρεσίες του Αρεταίειου νοσοκομείου είναι οργανωμένες στις παρακάτω Διευθύνσεις:

α) Διεύθυνση Διοικητικού:

• Τμήμα Προσωπικού.
• Τμήμα Γραμματείας.
• Τμήμα Παρακολούθησης Ασθενών και Αρχείου.
• Τμήμα Επιστασίας.

β) Διεύθυνση Οικονομικού:

• Τμήμα Λογιστηρίου.
• Τμήμα Προμηθειών.
• Τμήμα Διαχείρισης.
• Τμήμα Χρηματικού.
• Τμήμα Διατροφής.
• Τμήμα Πληροφορικής & Οργάνωσης.

γ) Διεύθυνση Τεχνικού:

• Τμήμα Τεχνικών Έργων.
• Τμήμα Βιοιατρικής Τεχνολογίας.